El Liceo Mixto “San Juan” fue fundado en 1967, inicio labores en 1968, en la casa del señor Aquiles Faillace (5ta. Calle 3-73, Amatitlán) y su Acta de Constitución legal fue otorgada por el Ministerio de Educación según Acuerdo de creación de fecha 25 de abril de 1968. Un año después (1969) se trasladó a la 4ª. Ave. 5-38 (donde actualmente está la Escuela Nacional de Párvulos “María Amanda Irene López Reyes”); el 2 de enero de 1970 pasó a funcionar en la 3ª. Ave. 5-51 (Casa de la Profa. Olga Aguilar de Roy, actualmente hay varios locales comerciales); en 1973 emigró a la 4ta. Ave. 5-34 (hoy Colegio Cultura) y finalmente después de este largo peregrinaje en 1981 se trasladó a su edificio propio ubicado en la 4ta. Ave. y 8ª. Calle 3-89 donde funciona actualmente.
Su Nombre, Liceo Mixto “San Juan”, evoca al más grande de los profetas que la Iglesia Católica nos presenta, El Profeta San Juan Bautista, con lo cual sus fundadores visionaron la grandeza que alcanzaría esta institución educativa. Además sus progenitores son personas que aman entrañablemente a su terruño y quisieron perpetuar en el Colegio el verdadero nombre de San Juan Amatitlán.
Desde su fundación, el Liceo Mixto “San Juan” ha procurado servir a la comunidad educativa a través de una enseñanza-aprendizaje de carácter integral basada en principios científicos, artísticos, deportivos, éticos, cívicos y morales que permitan al estudiante discernir entre el bien y el mal para integrarse a la sociedad como profesionales al servicio de sus semejantes y en consecuencia al servicio de nuestra patria Guatemala.
La proyección del Liceo Mixto “San Juan“ se ha dejado sentir en todos los aspectos de la vida de una sociedad, en el ramo profesional pueden observarse a cientos de exalumnos que en la actualidad son parte importante en diversas instituciones públicas y privadas desempeñándose exitosamente en las diferentes profesiones que gradúa nuestro Colegio.
